Independiente en el historial general acumula siete presentaciones sin poder vencer a Estudiantes. En ese lapso se registraron 4 éxitos albirrojos y 3 igualdades. Las últimas victorias del Rojo se remontan al 2011, donde se impuso en los dos partidos que se disputaron en el Apertura y Clausura de dicho año.
El primer encuentro que el Pincha recibió a los diablos de Avellaneda, en el Centenario de Quilmes, fue por el Apertura 2006. Fue el 22 de septiembre y ese encuentro tiene varias particularidades. El Pincha jugó por primera vez en su historia con una camiseta alternativa negra, que le había diseñado la empresa Topper y a partir de ahí el equipo de Diego Simeone consiguió una racha histórica de diez triunfos consecutivos y terminó consagrándose campeón en un desempate con Boca. A Independiente lo dirigía el ex entrenador de los platenses, Jorge Burruchaga y en ese partido sufrió una grave lesión Juan Huerta. Los del Cholo abrieron la cuenta con un tanto de José Luis Calderón, igualó Ismael Sosa y Agustín Alayes marcó el gol del triunfo.
Guido Carrillo fue sancionado tras la roja directa ante Tigre y se perderá una serie de partidos decisivos. Un nuevo dolor de cabeza para Eduardo Domínguez.
Por la suspensión de Guido Carrillo, un prometedor juvenil que firmó su primer contrato con Estudiantes podría integrar la lista de concentrados.
A partir de ese encuentro, Estudiantes comenzó a jugar como local en el Ciudad de La Plata y volvió a cruzarse con Independiente en Quilmes en el Apertura 2009. Se jugó el 13 de septiembre por la fecha 4 y los estudiantiles repitieron marcador y ganaron 2 a 1. El árbitro fue Carlos Maglio y el tanteador se abrió con un gol de Mauro Boselli, igualó Darío Gandín y a tres minutos del final convirtió el gol del triunfo el uruguayo Juan Manuel Díaz. Una de las curiosidades de este partido es que los técnicos fueron Alejandro Sabella y Américo Rubén Gallego, dos ex ayudantes de Daniel Passarella,
La tercera y última vez en tierras cerveceras fue el 29 de mayo del 2011 por el Torneo Clausura. El Rojo se impuso por 2 a 0, con tantos de Leonel Galeano y Lucas Villafañe. El árbitro del partido fue Patricio Loustau. Antonio Mohamed y Eduardo Berizzo eran los entrenadores.
En 170 partidos del profesionalismo el historial favorece a Independiente por 68 a 51, mientras que el número de empates es de 51. Siendo local Estudiantes fuera de su casa los números globales entre Quilmes y el Único alcanzan 10 cotejos. Ahí el Pincha ganó 7 con 12 goles a favor, Independiente 1 con 5 tantos convertidos y se registró una igualdad.