La historia de Estudiantes en esta Copa Argentina 2023 comenzó en el Estadio Centenario de Quilmes, donde con Abel Balbo en el banco de suplentes por los 32avos de final, le ganó con autoridad a Independiente Chivilcoy por 3 a 0 con goles de Mauro Méndez, Juan Cruz Guasone y Mauro Boselli.
Luego, y ya con Eduardo Domínguez como nuevo entrenador del equipo, fue el momento de disputar los 16avos de final ante All Boys, a quien terminó superando por 1 a 0 pero que tuvo que transpirar y mucho para poder quedarse con la victoria en el Estadio Centenario de Quilmes. El gol lo marcó el uruguayo Mauro Méndez.
En los 8vos de final llegó el turno de Independiente, a quien se enfrentó en el Estadio Islas Malvinas de Mendoza donde le terminó ganado 3 a 1 por penales, siendo la única fase en la que tuvo que llegar a esta definición. En tiempo reglamentario, había empatado 1 a 1. El gol del Pincha lo marcó Federico Fernández.
Así las cosas, llegó el momento de la maldita instancia la cual Estudiantes nunca había podido superar en Copa Argentina, los 4tos de final, donde se midió ante Huracán en el Estadio Coloso Marcelo Bielsa de Rosario y le ganó con claridad por 2 a 0 con goles de Lucas Souto en contra y Santiago Ascacíbar.
En la semifinal lo esperaba Boca, a quien en un verdadero partidazo le terminó ganando por 3 a 2 en el Estadio Mario Alberto Kempes de Córdoba, gracias a los goles de Guido Carrillo, Mauro Boselli y Nicolás Figal en contra. De esta manera, Estudiantes accedió por primera vez en su historia a la final de la Copa Argentina.
En el partido decisivo ante Defensa y Justicia, el equipo de Eduardo Domínguez se terminó imponiendo por 1 a 0 con gol de Guido Carrillo.